Hệ thực vật có sự giống nhau về cấu trúc với các đảo cận Nam Cực khác, đặc biệt là các đảo ở phía nam New Zealand. Thực vật trên đảo hiếm khi phát triển chiều cao hơn 1 mét, mặc dù cỏ Poa foliosa hình thành cây bụi có thể cao tới 2 mét trong các khu vực được che chắn. Trên đảo có hơn 45 loài thực vật có mạch, hơn 90 loài rêu cùng nhiều loài rêu tản và địa y. Các cây thân gỗ hoàn toàn vắng mặt trên đảo.

Hòn đảo có 5 thành tạo thực vật chính gồm: đồng cỏ, cánh đồng thảo mộc, đầm lầy kiềm, đầm lầy toan, cánh đồng núi. Hệ thực vật đặc hữu bao gồm Azorella macquariensis (Yareta Macquarie), Puccinellia macquariensis và hai loài lan quý hiếm là Corybas dienemus và Corybas sulcatus.[15]

Các loài động vật có vú trên đảo gồm Hải cẩu lông mao cận Nam Cực, Hải cẩu lông mao Nam Cực, Hải cẩu lông New Zealand, Hải tượng phương nam. Sự đa dạng của các loài trong Bộ Cá voi ít được biết đến hơn. Phổ biến nhất là Cá voi trơn phương nam[16] và Cá voi sát thủ cùng các loài cá voi di trú theo mùa là Cá nhà táng, Cá voi mõm khoằm.[17][18] Cái tên gọi là "Hải cẩu nội đia" được tìm thấy tại Nhóm đảo Antipodes và Macquarie được tuyên bố là phân loài của hải cẩu lông với lớp lông dày hơn, mặc dù không rõ liệu những con hải cẩu này có khác biệt về mặt di truyền hay không.[19]

Chim cánh cụt hoàng gia và Cốc mào Macquarie là những loài lai tạo đặc hữu. Cánh cụt vua, Chim cánh cụt Rockhopper phương Nam và Chim cánh cụt Gentoo cũng sinh sản ở đây với số lượng lớn. Hòn đảo đã được BirdLife International công nhận là Vùng chim quan trọng vì nó hỗ trợ môi trường sống của 13 loài chim với khoảng 3,5 triệu con.[20]